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Cell:借助CRISPR可绘制癌细胞必要基因图谱

来源:亚博网站手机登录链接   发布时间:2022-01-13 03:35nbsp;  点击量:

本文摘要:癌症是一种异质性疾病,具有遗传根源有所不同导致的许多亚型。因此,癌症存活所倚赖的多种途径和对抗癌药物的反应也有所不同。研究人员面对的挑战是精准地定义这些有所不同的途径,并认为可以作为新的抗癌化疗药物靶标的漏洞。 美国Whitehead研究所和Broad研究所的研究人员早已在应付这一挑战迈进了最重要的一步:他们在之前被测序的14事例急性髓系白血病细胞系中,顺利检验了癌细胞细胞分裂和存活必需的最重要基因。

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癌症是一种异质性疾病,具有遗传根源有所不同导致的许多亚型。因此,癌症存活所倚赖的多种途径和对抗癌药物的反应也有所不同。研究人员面对的挑战是精准地定义这些有所不同的途径,并认为可以作为新的抗癌化疗药物靶标的漏洞。

美国Whitehead研究所和Broad研究所的研究人员早已在应付这一挑战迈进了最重要的一步:他们在之前被测序的14事例急性髓系白血病细胞系中,顺利检验了癌细胞细胞分裂和存活必需的最重要基因。融合必要性基因的图谱和已不存在的基因组信息,他们的研究表明通过基因定义的癌症亚分类情况可以用作研发新的疗法。此项研究2月2日在线公开发表在cell上,为题“GeneEssentialityProfilingRevealsGeneNetworksandSyntheticLethalInteractionswithOncogenicRas”。

定义Ras特定基因的必要性网络研究的最重要内容集中于在和癌基因Ras涉及的基因和蛋白通路。Ras是在急性髓系白血病和其它人类癌症中,最广泛的变异癌基因。文章的第一作者TimWang说明:“在大多数情况下,变异的Ras蛋白本身被指出是‘无药可治’的。

另外一种方法是寻找Ras变异的癌症的其它基因,期望它们能用药物化疗。这样的‘Ras制备丧命’基因之前是十分无法分辨的。

”基于CRISPR基因编辑技术,研究人员可以测量分开敲除18000个人类基因组蛋白质编码基因的影响。通过较为Ras依赖型和非依赖型的细胞系找到了致癌物基因Ras的制备丧命伙伴基因。通讯作者DavidSabatini说明说道:“这个过程需要让我们迅速地证实在Ras变异细胞中选择性必须的基因名单。

我们指出这种标准化的方法可以在很多癌症的类型中找到漏洞。


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